TİGEM’in atçılık faaliyetleri ile ilgili bakım, besleme ve sağlık konularındaki esasları belirlemek, planlamaları yapmak, satışı yapılacak tayları tespit etmek, satılan atların yarış performanslarını takip etmek, damızlık üretimi için ihtiyaç duyulan aygır ve kısrak alımlarını planlamak Atçılık Daire Başkanlığının başlıca görevleri arasında yer alır.

TİGEM, dünyadaki önemli safkan Arap atı yetiştiriciliği ve ıslahı yapılan merkezlerdendir. Yıllardan beri yaptığı ıslah çalışmaları ile koşu performansı yüksek taylar elde etmiş ve safkan Arap atı yetiştiriciliğinde önemli bir konuma sahip olmuştur. TİGEM' de bu faaliyetin devam etmesi, safkan Arap atının ülkemizde safiyetinin korunması ve genetik iyileştirmenin sağlanması açısından önemlidir. Bu açıdan TİGEM, ülkemizdeki safkan Arap atı yetiştiriciliğinin teminatı konumundadır.

Safkan Arap atı yetiştiriciliği Karacabey, Anadolu ve Sultansuyu İşletmelerinde dünyada örneğine az rastlanan 49 ana, 12 baba kan hattı ile yapılmaktadır. Bu kan hatları her üç işletmede muhafaza edilerek Safkan Arap atı kan hatları güvence altına alınmaktadır. Üç işletmede toplam 1500 baş üzeri at varlığı ile faaliyetlere devam edilmektedir.